如果我们想要了解环境如何塑造生物的外观和行为，我们需要比较不同基因组成和环境经验的个体群体。对于复杂的表型特征，如人体的姿势或面部表情，比较并不简单，因为一些影响因素无法轻易地在个体间量化或平均。因此, 用计算方法来重建具有代表性的原型, 使用一系列的算法来填补缺失信息和计算手段。同样的问题也适用于植物的根系统体系结构 (RSA)。一些计算机程序可用于从根图像中提取数值数据, 但通常不提供自定义的数据分析或 RSA 的可视化重建。

EZ-Root-VIS综述

本文作者开发了Root-VIS，一款免费的软件工具，可以在用户选择的根映像集中帮助确定许多RSA特性的均值和方差。此外，Root-VIS提供了几种选项，可以根据平均数据生成根系统的可视化重建，从而实现筛选和建模。作者通过对拟南芥（Arabidopsis thaliana）的全基因组关联研究证实了Root-VIS与新版EZ-Rhizo的适用性，可用于快速表征基因型-环境相互作用和基因发现。

拟南芥在不同营养条件下的RSA性状

全基因组关联研究的根系结构特征

来源：Plant Physiology.EZ-Root-VIS: A Software Pipeline for the Rapid Analysis and Visual Reconstruction of Root System Architecture.Zaigham Shahzad, Fabian Kellermeier, Emily M. Armstrong, Simon Rogers, Guillaume Lobet, Anna Amtmann, Adrian Hills.